Skill ELO лишь меняет формулу подсчёта скилла. К самой статистике убийств/смертей(и тому подобным) он никакого отношения не имеет. Соответственно, проблем быть не должно.
В любом случае, при подобных манипуляциях целесообразно создавать бэкапы, ибо ситуации разные бывают.